Το Διοικητικό Συμβούλιο είναι το όργανο το οποίο εποπτεύει όλα τα Τμήματα. Αποφασίζει-εγκρίνει για τις πάσης φύσεως εργασίες, εκδηλώσεις και δαπάνες, που υποβάλλονται για έγκριση στο Μητροπολιτικό Συμβούλιο.

Πρόεδρος: Ο Σεβ. Αρχιεπίσκοπος Κρήτης κ. κ. ΕΙΡΗΝΑΙΟΣ

Αντιπρόεδρος: Ο Πρωτοσύγκελλος, Πανοσιολογιώτατος Αρχιμανδρίτης Μεθόδιος Βερνιδάκης.

Μέλη: 

Πρωτ. Νικόλαος Κριτσωτάκης, Αρχιερατικὸς Επίτροπος της Ζ΄ Αρχιερατικής Περιφέρειας, Αιδ. Πρωτ. Ανδρέας Καλιοντζάκης εκπρόσωπος του Συνδέσμου Ἐφημερίων της Ιεράς Αρχιεπισκοπής Κρήτης, οι κ. κ. Ιωάννης Σερπετσιδάκης, Δικηγόρος, Ευστάθιος Τζουανάκης, τ. Γενικός Διευθυντής Περιφέρειας Κρήτης και Δρ. Ιωάννης Λογιάδης, Πολιτικός Μηχανικός. 

Γενικός Γραμματέας: δ. Γεώργιος Γεράκης,  Email: gerakisgr@gmail.com.

Ταμίας: κ. Ελένη Κουκουριτάκη.

Υπεύθυνος επί των οικονομικών: κ. Μιχαήλ Σπαθαράκης.

Λογιστής: κ. Κουνετάκης Κωνσταντίνος.

Υπεύθυνη καθαριότητος: κ. Ψαθάκη Ειρήνη.